Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms