Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sgf29Q9DA08 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms