Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Cldn34b2Q9D9N2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Cldn34b2Q9D9N2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Cldn34b2Q9D9N2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms