Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms