Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Cldn22Q9D7U6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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Cldn22Q9D7U6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Cldn22Q9D7U6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Cldn22Q9D7U6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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