Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7N3

Mrps9, 28S ribosomal protein S9, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps9Q9D7N3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrps9Q9D7N3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrps9Q9D7N3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrps9Q9D7N3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrps9Q9D7N3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrps9Q9D7N3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrps9Q9D7N3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrps9Q9D7N3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrps9Q9D7N3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrps9Q9D7N3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrps9Q9D7N3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrps9Q9D7N3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrps9Q9D7N3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrps9Q9D7N3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrps9Q9D7N3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrps9Q9D7N3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrps9Q9D7N3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrps9Q9D7N3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrps9Q9D7N3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrps9Q9D7N3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrps9Q9D7N3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrps9Q9D7N3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrps9Q9D7N3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrps9Q9D7N3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrps9Q9D7N3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrps9Q9D7N3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrps9Q9D7N3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrps9Q9D7N3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrps9Q9D7N3 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrps9Q9D7N3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrps9Q9D7N3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrps9Q9D7N3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrps9Q9D7N3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrps9Q9D7N3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms