Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms