Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

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Length 937 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc39Q9D5Y1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
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Ccdc39Q9D5Y1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Ccdc39Q9D5Y1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Ccdc39Q9D5Y1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Ccdc39Q9D5Y1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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