Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc81Q9D5W4 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc81Q9D5W4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc81Q9D5W4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc81Q9D5W4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc81Q9D5W4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc81Q9D5W4 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc81Q9D5W4 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc81Q9D5W4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc81Q9D5W4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc81Q9D5W4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc81Q9D5W4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc81Q9D5W4 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc81Q9D5W4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc81Q9D5W4 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc81Q9D5W4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc81Q9D5W4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc81Q9D5W4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc81Q9D5W4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms