Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms