Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms