Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx29Q9D3S3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms