Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms