Protein–RNA interactions for Protein: Q9D300

Rasgef1c, Ras-GEF domain-containing family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1cQ9D300 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rasgef1cQ9D300 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rasgef1cQ9D300 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rasgef1cQ9D300 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rasgef1cQ9D300 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rasgef1cQ9D300 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rasgef1cQ9D300 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rasgef1cQ9D300 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rasgef1cQ9D300 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rasgef1cQ9D300 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rasgef1cQ9D300 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rasgef1cQ9D300 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms