Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chordc1Q9D1P4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms