Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms