Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZU3

Mtrex, Exosome RNA helicase MTR4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MtrexQ9CZU3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MtrexQ9CZU3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms