Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms