Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp11Q9CZJ1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp11Q9CZJ1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp11Q9CZJ1 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp11Q9CZJ1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp11Q9CZJ1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp11Q9CZJ1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp11Q9CZJ1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp11Q9CZJ1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp11Q9CZJ1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp11Q9CZJ1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp11Q9CZJ1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp11Q9CZJ1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp11Q9CZJ1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp11Q9CZJ1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp11Q9CZJ1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp11Q9CZJ1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp11Q9CZJ1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp11Q9CZJ1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp11Q9CZJ1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp11Q9CZJ1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp11Q9CZJ1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Utp11Q9CZJ1 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Utp11Q9CZJ1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Utp11Q9CZJ1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Utp11Q9CZJ1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Utp11Q9CZJ1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Utp11Q9CZJ1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Utp11Q9CZJ1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Utp11Q9CZJ1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Utp11Q9CZJ1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Utp11Q9CZJ1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms