Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms