Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms