Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Exo5Q9CXP9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.05■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Exo5Q9CXP9 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms