Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Sgo1Q9CXH7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Sgo1Q9CXH7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Sgo1Q9CXH7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Sgo1Q9CXH7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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