Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Cnot11Q9CWN7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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