Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms