Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV82

2310003L06Rik, RIKEN cDNA 2310003L06 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310003L06RikQ9CV82 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms