Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms