Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fcf1Q9CTH6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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