Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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