Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg12Q9CQY1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms