Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms