Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms