Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms