Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmed6Q9CQG0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms