Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

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Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Rpl39lQ9CQD0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Rpl39lQ9CQD0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Rpl39lQ9CQD0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Rpl39lQ9CQD0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Rpl39lQ9CQD0 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Rpl39lQ9CQD0 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Rpl39lQ9CQD0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Rpl39lQ9CQD0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Rpl39lQ9CQD0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Rpl39lQ9CQD0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl39lQ9CQD0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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