Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQC3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQC3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQC3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQC3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQC3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQC3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQC3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQC3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQC3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQC3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms