Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms