Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ36

Pole4, DNA polymerase epsilon subunit 4, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole4Q9CQ36 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pole4Q9CQ36 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms