Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ccdc198Q9CPZ1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Ccdc198Q9CPZ1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Ccdc198Q9CPZ1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Ccdc198Q9CPZ1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Ccdc198Q9CPZ1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Ccdc198Q9CPZ1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Ccdc198Q9CPZ1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Ccdc198Q9CPZ1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc198Q9CPZ1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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