Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxb1Q9CPU1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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