Protein–RNA interactions for Protein: Q99P87

Retn, Resistin, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetnQ99P87 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
RetnQ99P87 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RetnQ99P87 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RetnQ99P87 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
RetnQ99P87 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RetnQ99P87 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RetnQ99P87 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RetnQ99P87 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RetnQ99P87 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RetnQ99P87 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RetnQ99P87 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RetnQ99P87 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RetnQ99P87 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RetnQ99P87 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RetnQ99P87 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RetnQ99P87 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RetnQ99P87 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RetnQ99P87 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RetnQ99P87 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RetnQ99P87 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RetnQ99P87 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RetnQ99P87 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RetnQ99P87 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RetnQ99P87 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RetnQ99P87 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RetnQ99P87 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RetnQ99P87 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RetnQ99P87 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RetnQ99P87 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RetnQ99P87 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RetnQ99P87 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RetnQ99P87 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RetnQ99P87 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RetnQ99P87 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RetnQ99P87 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RetnQ99P87 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RetnQ99P87 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RetnQ99P87 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RetnQ99P87 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RetnQ99P87 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
RetnQ99P87 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
RetnQ99P87 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RetnQ99P87 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
RetnQ99P87 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RetnQ99P87 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RetnQ99P87 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RetnQ99P87 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
RetnQ99P87 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RetnQ99P87 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RetnQ99P87 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RetnQ99P87 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
RetnQ99P87 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RetnQ99P87 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RetnQ99P87 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RetnQ99P87 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RetnQ99P87 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RetnQ99P87 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RetnQ99P87 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RetnQ99P87 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RetnQ99P87 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RetnQ99P87 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RetnQ99P87 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RetnQ99P87 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RetnQ99P87 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RetnQ99P87 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RetnQ99P87 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RetnQ99P87 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RetnQ99P87 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RetnQ99P87 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RetnQ99P87 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RetnQ99P87 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RetnQ99P87 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RetnQ99P87 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RetnQ99P87 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RetnQ99P87 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RetnQ99P87 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RetnQ99P87 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RetnQ99P87 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RetnQ99P87 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RetnQ99P87 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RetnQ99P87 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RetnQ99P87 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RetnQ99P87 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RetnQ99P87 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RetnQ99P87 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RetnQ99P87 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RetnQ99P87 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RetnQ99P87 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RetnQ99P87 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RetnQ99P87 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RetnQ99P87 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RetnQ99P87 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RetnQ99P87 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RetnQ99P87 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RetnQ99P87 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RetnQ99P87 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RetnQ99P87 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RetnQ99P87 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
RetnQ99P87 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RetnQ99P87 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms