Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms