Protein–RNA interactions for Protein: Q99LL5

Pwp1, Periodic tryptophan protein 1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pwp1Q99LL5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pwp1Q99LL5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pwp1Q99LL5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pwp1Q99LL5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pwp1Q99LL5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pwp1Q99LL5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pwp1Q99LL5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pwp1Q99LL5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pwp1Q99LL5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pwp1Q99LL5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pwp1Q99LL5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pwp1Q99LL5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pwp1Q99LL5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pwp1Q99LL5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pwp1Q99LL5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pwp1Q99LL5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pwp1Q99LL5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pwp1Q99LL5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pwp1Q99LL5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pwp1Q99LL5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pwp1Q99LL5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pwp1Q99LL5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pwp1Q99LL5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pwp1Q99LL5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pwp1Q99LL5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pwp1Q99LL5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pwp1Q99LL5 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pwp1Q99LL5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pwp1Q99LL5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms