Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms