Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms