Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TriobpQ99KW3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms