Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ubxn2aQ99KJ0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms