Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms