Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Odf3Q920N1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Odf3Q920N1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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