Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Rpe65Q91ZQ5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpe65Q91ZQ5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpe65Q91ZQ5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpe65Q91ZQ5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpe65Q91ZQ5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpe65Q91ZQ5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
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Rpe65Q91ZQ5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpe65Q91ZQ5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Rpe65Q91ZQ5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpe65Q91ZQ5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpe65Q91ZQ5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpe65Q91ZQ5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpe65Q91ZQ5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpe65Q91ZQ5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpe65Q91ZQ5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpe65Q91ZQ5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpe65Q91ZQ5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpe65Q91ZQ5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpe65Q91ZQ5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpe65Q91ZQ5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpe65Q91ZQ5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpe65Q91ZQ5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpe65Q91ZQ5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Rpe65Q91ZQ5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpe65Q91ZQ5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpe65Q91ZQ5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpe65Q91ZQ5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpe65Q91ZQ5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpe65Q91ZQ5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Rpe65Q91ZQ5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Rpe65Q91ZQ5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Rpe65Q91ZQ5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Rpe65Q91ZQ5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Rpe65Q91ZQ5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpe65Q91ZQ5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpe65Q91ZQ5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpe65Q91ZQ5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpe65Q91ZQ5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpe65Q91ZQ5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpe65Q91ZQ5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Rpe65Q91ZQ5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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